A Capitania dos Portos de Penedo, pertencente à Marinha do Brasil, é responsável pela fiscalização e segurança da navegação nas águas interiores da região, especialmente no Rio São Francisco. Com foco na proteção e organização das atividades fluviais, a capitania atua no treinamento de marinheiros, na fiscalização de embarcações e na promoção de campanhas de segurança. Além de sua função operacional, a Capitania dos Portos tem um importante papel histórico, refletindo a tradição naval e a importância do rio para o desenvolvimento de Penedo e de Alagoas.